中共厦门市委统战部组建于1950年3月，1950年12月正式设立工作机构，内设调研科、联络科、秘书室三个科室。1955年，内设科室改为干部科、党派科、工商科和秘书室。
    文化大革命开始后，统战部工作机构陷入瘫痪，机关干部分流到其他部门。1971年，市革委会成立政治处外事组，下设统战组、侨务组，由统战组履行原统战部的部分职能。
    1976年1月，市委统战部恢复。1978年10月，市委统战部下设秘书科、政工科、工商党派科、民族宗教科。1979年3月，市委统战部民族宗教科撤销，成立市宗教事务处，仍归口市委统战部领导。1981年2月，市委统战部政工科改称干部科。同年，市委统战部增设侨务办公室。1983 年起，各区区委统战部先后成立。1985年，市委统战部各科改为处。1986年8月，市委侨务办公室改为市政府侨务办公室，归口市政府系列。1989年3月，秘书处改称办公室。1991年6月，厦门市宗教事务处改为厦门市宗教事务局，列入市政府工作部门，仍归口市委统战部领导。市委统战部的编制，1988年为20人，1991年增加至25人。1995年市委统战部内设办公室、组织处、党派处和联络处四个处室。

(摘自<厦门市统一战线志>,1999年出版)

      2007年5月，市委统战部增设新的社会阶层人士处。